犬尿氨酸通路化合物库

Name: 犬尿氨酸通路化合物库
Brand: TargetMol
SKU: EN3200

Kynurenine Pathway Library From Enamine

很棒

产品编号EN3200

犬尿氨酸途径是一种从色氨酸降解产生烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NAD+）的代谢途径。该途径的紊乱与多种疾病和障碍相关，包括传染病（例如，HIV）、神经系统疾病（阿尔茨海默病、亨廷顿病和肌萎缩侧索硬化症）、情感障碍（精神分裂症、抑郁症和焦虑症）、自身免疫性疾病、外周性疾病以及恶性肿瘤。我们工作的目标是寻找犬尿氨酸途径中新的潜在活性化合物，这些化合物可以作为早期药物开发中便捷且优质的起点。
https://enamine.net/compound-libraries/targeted-libraries/immuno-oncology-library/kynurenine-pathway-library

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产品编号EN3200

犬尿氨酸通路化合物库

规格

1 mg
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)

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产品描述

库设计
潜在活性化合物的筛选基于以下靶点的所有可用蛋白质和配体结构数据：吲哚胺双加氧酶（IDO）、色氨酸双加氧酶（TDO）、3-羟基邻氨基苯甲酸双加氧酶（3-HAO）、大尿氨酸氨基转移酶（KATs）、大尿氨酸3-单加氧酶（KMO）。

图1. 哺乳动物中色氨酸分解的犬尿氨酸代谢途径。

筛选模型的准备与验证
从PDB数据库获取了所有目标蛋白的可用3D结构。对蛋白质结构进行交替叠加和比较分析显示，各独立靶标的序列同一性均高于90%，RMSD值在0.4-0.71 Å²范围内。综合评估配体结合参数（蛋白质-天然配体）和结合位点的几何参数后，从所有代表性结构中仅选取一个用于模型构建。

图2. IDO1 的结合位点（2D0T（上）、4PK5（下）），以及用于分子对接的两个主要子口袋（蓝色和黄色）示例。

分子对接与药效团搜索
基于已知活性化合物和“蛋白质-天然配体”复合物，构建并验证了基于配体（IDO: 3, TDO: 4, KATs: 3, KMO: 2）和基于结构（IDO: 3, TDO: 6, 3-HAO: 2, KATs: 3, KMO: 4）的药效团模型。随后，对包含超过一百万个化合物的类药Enamine数据库进行了筛选。

图3. 分子对接结果：天然配体（灰色）与命中配体（黄色）叠加图，并展示基于结构的药效团特征。

分子举例

图4. 基于配体的用于计算机筛选的药效团模型。

分子对接计算和药效团筛选后靶向库中的化合物数量：

Target Name	IDO	TDO	3-HAO	KATs	KMO
Number of compounds in the library	4 800	5 120	1 000	1 000	3 200

对犬尿氨酸通路中涉及的蛋白质及其配体相互作用进行了详尽分析。采用现有最先进的计算方法进行迭代性计算机筛选，最终获得多组具有潜在活性的独特分子结构。通过化学型控制策略，以已知活性分子的结构基序和新型"无专利壁垒"结构核心对化合物库进行富集优化。所开发的目标化合物集旨在针对特定靶点实现高概率的一步式初始活性分子发现。