Vascular Endothelial Growth Factor Receptor Kinase 2 (VGFR-2) Focused Library
产品编号LF5300
在调节正常和病理性血管生成过程中,VEGF家族和它们对应的受体酪氨酸激酶(VEGFR-1、VEGFR-2和VEGFR-3)是涉及调控多个血管生成和淋巴生成过程以及诱导血管通透性和炎症的关键和不可或缺的因子。受体VEGFR-2是VEGF通过其对寄主血管产生有丝分裂、趋化和血管通透性效应的主要受体。肿瘤细胞产生的VEGF和肿瘤相关血管的VEGFR-2的表达增加是多种人类和啮齿动物肿瘤的标志,在体内与肿瘤生长速度、微血管密度/增殖、肿瘤转移潜力以及多种恶性肿瘤的患者预后不良有关。破坏VEGF/VEGFR信号传导级联的方法包括生物制剂(可溶性受体、抗VEGF和抗VEGFR-2抗体以及VEGF转录抑制剂)和小分子ATP竞争性VEGFR抑制剂。
Life Chemicals VGFR-2 靶向库是潜在VGFR-2 II型抑制剂的集合。II型激酶抑制剂相比I型激酶抑制剂具有多个优势,包括更好的激酶选择性。因此,我们重点研究了可能的VGFR激酶II型抑制剂的鉴定。我们创建了一个基于结晶结构3VHE PDB记录的蛋白质的对接模型。超过1,000个现有化合物被确定为血管内皮生长因子受体激酶2(VGFR-2)专注库的虚拟命中物。
规格
目前在临床开发阶段的后一类别的化合物包括来自不同化学类别的化合物。负责与配体氢键作用的关键氨基酸被设定为来自铰链区域的Cys919,以及保守的Glu885和Asp1046。识别并包含在VEGFR-2结合位点的两个疏水区域用于对接约束:第一个区域由Phe1047的DFG外构象重排形成,第二个区域是 Ile892、Leu1019、Phe1018内形成的一个扩展疏水口袋。使用DOCK4.0-6.0程序进行了分子对接及随后的结果分析。使用GROMACS软件进行了分子动力学(MD)模拟和蛋白质结构的准备。配体分子经过GAMESS和GROMACS处理。仅选择符合Lipinski和Veber规则的化合物进行对接筛选。