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SOS1抑制剂筛选库

SOS1 Inhibitor Screening Library

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产品编号LF2390

SOS1(Son of Sevenless 1)是一种关键的鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF),可激活RAS-MAPK信号通路中的RAS蛋白,该通路是调控细胞增殖、分化和存活的关键级联反应。RAS-MAPK级联反应的异常激活与多种癌症有关,包括胰腺腺癌、非小细胞肺癌(NSCLC)和幼年型粒单核细胞白血病,使得SOS1成为一个具有战略重要性和治疗可操作性的靶点。破坏SOS1–KRAS蛋白-蛋白相互作用(PPI)是抑制致癌RAS信号传导的一种已验证方法。

我们的化学信息学团队制备了一个专门的预测性小分子SOS1抑制剂筛选库。

关键特点
2,600种类药化合物
靶点:SOS1(RAS通路调节)
聚焦于SOS1-KRAS PPI破坏
基于结构的设计和对接精炼
经过类药性和药物化学适用性过滤
适用于以肿瘤学为重点的命中发现

TargetMol 的所有产品和服务仅用于科学研究,不能被用于人体,我们也不向个人提供产品和服务。
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产品编号LF2390

SOS1抑制剂筛选库

规格

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科学依据

直接靶向突变RAS蛋白在历史上一直具有挑战性,由于其对GTP的高亲和力及有限的成药结合口袋,RAS曾被称为“不可成药”靶点。近期的结构和生物化学进展已将SOS1确定为可行的上游靶点,小分子能够结合SOS1–KRAS界面上明确的结合口袋。此类抑制剂可通过稳定SOS1非活性构象或破坏SOS1–KRAS复合物形成来减弱RAS激活,从而阻断下游致癌信号传导。

 SOS1 Inhibitor Screening Library
图1. Ras-MAPK通路中的SOS1功能获得性变异体 [DOI: 10.1038/s41398-023-02504-4]

化合物筛选策略

本筛选库通过基于结构的虚拟筛选开发,使用了SOS1的晶体结构(PDB ID: 8XJJ)。蛋白质准备包括优化质子化状态、侧链校正和结合位点验证。

使用一组已知SOS1抑制剂作为参考数据库来基准测试对接性能。高通量虚拟筛选(HTVS)后,进行额外精度对接以精炼结合亲和力预测。最终的化合物筛选整合了以下步骤:

  • 内部类药性过滤器
  • PAINS和结构缺陷过滤器
  • 去除化学上不希望或不具类药性的化学类型

最终形成的筛选库包含超过2,600种化学多样、合成可行的分子,具有高SOS1结合潜力、较低的测定干扰风险,并适用于下游药物化学优化。

 SOS1 Inhibitor Screening Library
图2. 测试对接过程中蛋白质结构与表面的验证。
 SOS1 Inhibitor Screening Library
图3. 化合物F6677-1629在SOS1蛋白结合位点中的结合状态。该复合物通过分子对接获得。

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  • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
  • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
  • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。

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