

ROCK Targeted Library
产品编号LF5200
ROCK (Rho-associated protein kinases)是参与许多细胞运动调控过程的丝氨酸/苏氨酸激酶,从细胞迁移到细胞收缩以及对微管数量的控制。ROCK靶向库中的化合物总数为1,360个。
规格
采用Schrödinger软件对ROCK1和ROCK2亚型进行虚拟筛选,该软件同时用于制备蛋白质分子构象。两个ROCK激酶结构(PDB编号:2ESM与4L6Q)均通过蛋白预处理工具进行优化。此外,通过LigPrep模块对ChEMBL数据库中IC50值低于1.5µM的已知ROCK1/ROCK2抑制剂进行处理,生成不同pH状态下的三维构象(Epik技术)。后续所有分子对接流程均采用Glide软件完成(图1)。在对接阶段设定了氢键约束条件与疏水作用区域。通过将库存化合物的对接得分与ChEMBL测试化合物的得分区间进行比对,依据对接评分值筛选出候选化合物。
