RNA Screening Subset by Bayesian Modeling
产品编号LF1152
"RNA的主要功能是通过翻译过程生成蛋白质。已知有三种主要类型的RNA参与蛋白质合成:
信使RNA(mRNA):从DNA转录而来,包含制造蛋白质的遗传蓝图;
转运RNA(tRNA):将氨基酸运送至核糖体,并将mRNA翻译成蛋白质;
核糖体RNA(rRNA):形成核糖体,核糖体在蛋白质合成中至关重要,并将氨基酸连接起来形成编码的蛋白质。
非编码RNA(ncRNA)是一种不翻译成蛋白质的RNA分子。一些RNA还作为催化RNA(也称为核酶)驱动生化反应(如蛋白质合成、RNA剪接和RNA切割);它们可以与辅助蛋白质配对以完成其催化功能。其他RNA的作用包括RNA编辑、基因调控和RNA干扰。这些过程由一组小调控RNA执行,包括小核RNA、微RNA和小干扰RNA。
RNA也是病毒的主要遗传物质。虽然RNA主要以单链形式存在,但某些RNA病毒是双链的。
近期,已确立的基于RNA的分子靶点数量有所增加,其结构与功能关系的详细解析也已报道。多种小分子抑制剂已成功开发,针对各类RNA分子。研究表明,致癌性微小RNA在多种癌症的发生和进展中起着关键作用。此外,针对泛耐药细菌的治疗,基于RNA的新型药物发现策略正在被考虑。"
基于贝叶斯模型筛选出超过1000种类药化合物。
规格
库设计:
为构建这一以RNA为核心的筛选库,采用了与通过二维相似性搜索构建的RNA聚焦库相同的已知RNA结合化合物训练集,以此建立贝叶斯模型。该方法旨在运用贝叶斯分类学原理,从已验证活性的化合物中甄别出“优质”分子。贝叶斯模型的构建过程融合了分子指纹(圆形FCFP6指纹)与分子特性(包括分子量、氢键受体数量、氢键供体数量、分配系数对数、极性表面积、可旋转键数量及环状结构数量)两大要素。
接下来,将开发的贝叶斯模型应用于Life Chemicals高通量筛选化合物库,以筛选靶向RNA的化合物。从结果集中过滤掉含有PAINS(泛筛选干扰化合物)及具有“不良”和反应性基团的分子。最终,筛选出超过1000种类药性化合物。