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RNA靶向化合物库
RNA Focused Library
产品编号: LF6800

大多数临床批准的小分子药物都是针对蛋白质而建立的。也有研究表明RNA参与了多种疾病的进展,包括感染性疾病(病毒感染,如HIV、艾滋病、丙型肝炎)和代谢性疾病(如糖尿病、癌症),以及三联体重复导致的疾病(强直性肌营养不良、亨廷顿病等)。用小分子药物靶向RNA为治疗由其直接调节的多种细胞过程(如转录、剪接、翻译和表观遗传修饰)提供了新的机会,包括那些与“不可成药”的蛋白质靶点相关的细胞过程。Life Chemicals开发了独家RNA筛选库,其中包含超过29,200种预测具有RNA结合活性的类药小分子化合物。

国内备有现货产品,包含1735种化合物,货期更短,性价比更高,欢迎咨询!

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务。
产品规格

越来越多的研究关注于RNA的分子靶点,并对其结构和功能关系进行了详细阐述。目前已成功开发了一系列针对不同RNA的小分子抑制剂。致癌性microRNA与各种癌症的发展和进展密切相关。基于RNA的新颖药物发现策略正在考虑用于治疗药物耐药细菌。RNA Focused Library是通过两种基于配体的方法设计的。 通过2D相似性搜索的RNA筛选子集 首先,从文献中收集了大约750种能够与RNA结合的报道化合物(由SMMRNA、PDB和ChEMBL数据库收集的数据)。通过丢弃具有低解离常数(Kd > 10μM;抑制剂IC50等<=10μM)的化合物,将其缩小到具有结合活性的化合物。接下来,对Life Chemicals HTS Compound Collection进行了2D相似性搜索,以保持多样性(Tanimoto指数和Tversky指数分别≥0.80和≥0.85)。使用基于片段的/化学散列指纹来比较化合物结构。最后,应用PAINS、反应性基团和内部开发的Medchem过滤器来提供结果化合物集。

通过贝叶斯建模的RNA筛选子集 使用相同的已知RNA结合化合物的训练集构建了一个贝叶斯模型(贝叶斯分类方法),以区分具有已知活性的“良好”分子与其他化合物。在构建贝叶斯模型时,涉及分子指纹(环形FCFP6指纹)和分子性质(分子量、受体数、供体数、LogP、极性表面积、旋转键数、环数)。接下来,将该模型应用于Life Chemicals HTS Compound Collection,以选择针对RNA的筛选化合物。从结果化合物集中过滤出PAINS和具有“不良”和反应性基团的化合物。

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化合物库组成
化合物库信息示例
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Tirasemtiv Roniacol Rg3039 Z433927330 Desloratadine CH5132799 5-Bromoindole Smurf1-IN-A01 Halosulfuron-methyl Piceatannol
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ML346 SB 4 Daclatasvir Daclatasvir dihydrochloride NADPH (tetracyclohexanamine) AZD8055 Vistusertib PAβN dihydrochloride HZ1157 Rotundine
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