药物发现中的“优势片段”概念是指一组具有独特化学结构的小分子,更有可能与生物靶点进行有利的相互作用。优势片段已被确定为药物发现的有价值的起点,因为它们能够与广泛的靶蛋白结合,并具有优化成先导化合物的潜力。
优势片段标记(PFA)库的开发建立在这个概念之上,提供了一个特殊的收集优势片段化合物,这些化合物已经被标记了结构、生化和药理学信息。这些标记旨在为研究人员提供更全面的了解优势片段的分子特性和功能机制,从而更有效地开发药物。
PFA库包含一组精选的优势片段,这些片段是根据它们对各种目标靶点的广泛适用性以及它们进一步优化和药物开发的潜力而选择的。该库包括属于不同化学类别的化合物,如杂环支架、多环芳烃和大环支架等。
PFA库的标记旨在为研究人员提供对优势片段的更高层次的结构和功能洞察。这包括诸如片段与靶蛋白的结合亲和力,它们参与的药理学途径以及负责其活性的结构决定因素等信息。标记信息通常是通过实验和计算相结合的方法获得的,包括结构生物学、核磁共振波谱和分子建模。
PFA库可用于药物发现的各个阶段,从基于片段的筛选到先导优化等。库中的片段可以作为分子库设计或化学开发候选物鉴定的起点。所提供的标记信息也使研究人员能够更好地了解片段的分子特性,并指导这些化合物的优化,使其成为更有效和选择性的先导候选物。
优势片段标记库是药物发现研究的宝贵资源,它提供了具有独特化学结构的优势片段的集合,并标记了结构、生化和药理信息。通过利用优势片段的优势作为药物发现的起点,并将它们与丰富的标记数据相结合,PFA库可以帮助识别新的化学起点和优化治疗药物的先导化合物。
该库目前总化合物数190000个,包括四大类23个子库,每一个子库作用于特定靶点或靶点类别的分子通常具有的特征性结构基团:
酶:氨酰转移酶(Aminoacyltransferase)、水解酶(Hydrolases)、异构酶(Isomerases)、激酶(Kinases)、连接酶(Ligases)、裂解酶(Lyases)、氧化还原酶(Oxidoreductases)、磷酸酶(Phosphatases)、蛋白酶(Proteases)、转移酶(Transferases)、磷酸二酯酶(Phosphodiesterases);
膜受体:β淀粉样 A4蛋白(βAmyloid A4 protein)、A 型 G 蛋白偶联受体家族(Family A GPCR)、B 型 G 蛋白偶联受体家族(Family B GPCR)、C 型 G 蛋白偶联受体家族(Family C GPCR)、Frizzled 家族G 蛋白偶联受体(GPCR Frizzled family)、Taste 家族G 蛋白偶联受体(GPCR Taste family)、σ阿片受体(σOpioid receptor)、血小板生成素受体(Thrombopoietin receptor);
离子通道:电压门控离子通道(Voltage-gated)、配体门控离子通道(Ligand-gated);表观遗传调节因子(Epigenetic regulator)。
Empty | 1000025-07-9 | 1000413-72-8 | 229005-80-5 | 1000787-75-6 | 946387-07-1 | 1000998-59-3 | 1175526-27-8 | 1001288-58-9 | 1001350-96-4 | 1001404-83-6 | Empty |
Vadadustat | TAK875 | TAK-779 | Tegobuvir | RN-1734 | BMS-687453 | AM211 | FT011 | BMS754807 | AAI101 | ||
Empty | 1001625-82-6 | 1001645-58-4 | 1001753-24-7 | 1001908-89-9 | 1002304-34-8 | 1002-84-2 | 100291-86-9 | 100299-08-9 | 10030-52-1 | 10040-45-6 | Empty |
RPW-24 | SRT1720 hydrochloride | INH6 | SRT 2183 | AMG208 | Pentadecanoic acid | Apiopaeonoside | Pemirolast potassium | L-Anserine nitrate salt | Sodium Picosulfate | ||
Empty | 100427-26-7 | 1004316-88-4 | 10045-45-1 | 100462-37-1 | 1004990-28-6 | 100-51-6 | 1005-24-9 | 1005264-47-0 | 1005334-57-5 | 1005342-46-0 | Empty |
Lercanidipine | Cobicistat | 1-Ethyl-2-benzimidazolinone | ROSIRIDIN | PF-AKT400 | Benzyl alcohol | 1-Methylnicotinamide chloride | MX69 | CVT-10216 | LCL161 | ||
Empty | 1005491-05-3 | 100-55-0 | 1005504-62-0 | 1005883-72-6 | 100643-71-8 | 1007207-67-1 | 10075-50-0 | 1007647-73-5 | 100784-20-1 | 10083-24-6 | Empty |
Tirasemtiv | Roniacol | Rg3039 | Z433927330 | Desloratadine | CH5132799 | 5-Bromoindole | Smurf1-IN-A01 | Halosulfuron-methyl | Piceatannol | ||
Empty | 100872-83-1 | 100874-08-6 | 1009119-64-5 | 1009119-65-6 | 100929-71-3 | 1009298-09-2 | 1009298-59-2 | 100929-99-5 | 1009734-33-1 | 10097-84-4 | Empty |
ML346 | SB 4 | Daclatasvir | Daclatasvir dihydrochloride | NADPH (tetracyclohexanamine) | AZD8055 | Vistusertib | PAβN dihydrochloride | HZ1157 | Rotundine | ||
Empty | 1009816-48-1 | 1009817-63-3 | 1009820-21-6 | 100986-85-4 | 101001-34-7 | 1010411-21-8 | 1010-60-2 | 1011244-68-0 | 1011301-27-1 | 1011529-10-4 | Empty |
Thiamet G | B-AP15 | Silmitasertib | Levofloxacin | Pamicogrel | GSK369796 Dihydrochloride | 2-Chloronaphthoquinone | TFAP | Tenovin3 | Azvudine | ||
Empty | 101152-94-7 | 101155-02-6 | 1011557-82-6 | 1011-74-1 | 101-20-2 | 1012054-59-9 | 101-21-3 | 101-26-8 | 101303-98-4 | 1013101-36-4 | Empty |
Milnacipran hydrochloride | BW-A78U | Tenovin-6 | DL-Normetanephrine hydrochloride | Triclocarban | CUDC101 | Chlorpropham | Mestinon | Zacopride hydrochloride | PF04691502 | ||
Empty | 101-31-5 | 1013-69-0 | 1013750-77-0 | 1013753-99-5 | 10138-52-0 | 1013920-15-4 | 1013937-63-7 | 1014691-61-2 | 101477-54-7 | 101494-95-5 | Empty |
L-Hyoscyamine | Noreugenin | ML-030 | BC-1382 | Gadolinium chloride | Vorolanib | VTP-27999 TFA | GSK0660 | Lomerizine hydrochloride | 8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE |