PPI 片段化合物库
PPI Fragment Library
很棒产品编号LF8500
蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）是现代药物设计和开发中最具吸引力的靶点之一。然而，这一相互作用领域尚未得到充分探索，且参与其中的所有蛋白质并不存在普遍特征。迄今为止，已有数十对蛋白质对得到深入研究，其晶体结构揭示了界面间紧密连接的机制。这些研究是一项耗时费力的艰巨任务，但可以通过开发一个专注于抑制蛋白质-蛋白质相互作用的基于片段的筛选库来加以推进。
与高通量筛选（HTS）相比，基于片段的药物发现（FBDD）被证明是设计新型PPIs调节剂的更好方法，因为PPI界面通常由不连续的“热点”组成。核磁共振（NMR）、X射线晶体学、表面等离子体共振（SPR）和质谱（MS）均可用于理论的发现和验证。
基于对已发表数据的全面分析，我们制定了一套描述符和片段排列的排序机制，从而设计了专有的PPI片段库，包含14,800种即用型类片段化合物，用于PPI相关的FBDD。该筛选集同时跨越了片段和PPI抑制剂的化学空间。
产品编号LF8500
PPI 片段化合物库规格
- 1 mg
- 100 μL x 10 mM (in DMSO)
- 250 μL x 10 mM (in DMSO)
产品描述
化合物筛选
研究表明，PPI抑制剂通常比作用于大多数蛋白质更标准结合位点的抑制剂更大且更亲脂。这就是为什么PPI片段的TPSA值高于在常见基于片段的药物设计方法中通常所主张的范围。同样的情况也适用于化合物的分子量，其应在250至450 Da之间。因此，这类化合物无法符合通常用于片段选择的标准“三规则”。
| Parameter | MW | ClogP | TPSA | RotBonds | HbD | HbA | Fsp3 | Hydrophobic cores | Rings | npr1+npr2 |
| Range | 250 - 450 | 2.5 - 4.5 | < 75 Å2 | ≤8 | ≤ 3 | ≤ 5 | > 0.4 | 1 - 5 | > 0 | > 1.07* |
研究发现，靶向PPI的小分子在外围亲脂性取代基内具有高度疏水的核心。为增强选择性，我们提出了经过合理选择的疏水性和更具空间结构（富含sp³）的分子。
上述特征汇总的主要结果是形成了一个具有PPI相互作用抑制共同功能的化合物特殊化学空间。表征PPI片段的另一个细节是主惯性矩（PMI）。npr1 = 0.24，npr2 = 0.89的平均值显示了化合物在三维空间中的分布，并评估了3D形状多样性。最后，化合物通过了PAINS过滤器。
包装和储存
- 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
- 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
- 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。
包装和储存
- 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
- 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
- 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。
化合物库定制
