蛋白相互作用片段化合物库

PPI Fragment Library From Enamine

产品编号： EN5200

蛋白质相互作用调节着其生命周期的大部分方面，因此成为当代药物开发中具吸引力和前景的靶点。然而，这个领域的研究还不够深入，对于参与这种类型相互作用的蛋白质没有共同的规律。PPI（蛋白质-蛋白质相互作用）片段库包含3600个化合物。 https://enamine.net/compound-libraries/fragment-libraries/ppi-fragments

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陶术生物化合物库目录(28.1MB)

库化合物信息

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Key features 产品描述

Key features

Recent researches in the field of PPI fragments revealed the requirement of higher molecular weight molecules compared to common fragments due to a larger contact surface area. Therefore “Rule of four” restrictions were used to extract the initial PPI fragments subset, as they are typically larger and more lipophilic. Additionally, a machine-learning method (decision tree) with a number of validated descriptors was used to refine the library. The “hot-spots” concept has been applied, implying the use of “key” amino acid residues involved in PPIs. A significant number of the selected fragments contains groups/moieties which correspond to these hot spots. Additionally, the library was enriched with the molecules having alpha helix-like structure, able to mimic protein motifs. Also since hydrogen bonds often play a crucial role in PPIs the preference was set for the molecules bearing at least one H-bond donor (> 70 %) and one H-bond acceptor (100%).

这样复杂的生物系统无法通过传统的高通量筛选方法和算法进行成本效益高的处理。然而，基于片段的方法在搜索新的蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）抑制剂方面表现出了积极的结果。我们创建了一个新的PPI片段库，采用专门设计的方法，结合了对常见PPI抑制剂的系统性知识和优越的结构基元选择。使用我们的PPI片段库进行筛选，您可以获得多重优势，帮助您在引导化合物生成过程中节省时间和成本。库中的每个片段都可以通过现有库存类似物或通过我们的REAL数据库技术轻松进行后续跟踪或合成新的衍生物。

主要特点：在PPI片段领域的最新研究揭示了与常见片段相比，较高的分子量对于PPI有更大的接触表面积要求。因此，我们使用“四原则”限制来提取初始的PPI片段子集，因为它们通常更大且更亲脂。此外，还使用了基于机器学习的方法（决策树）和一系列经过验证的描述符来精细调整库的内容。我们应用了“热点”概念，即使用参与PPI的“关键”氨基酸残基。许多选定的片段包含与这些热点相对应的基团/部分结构。此外，该库还富集了具有α螺旋结构的分子，可以模拟蛋白质的结构基元。由于氢键在PPI中通常起着关键作用，因此偏好具有至少一个氢键给体（> 70％）和一个氢键受体（100％）的分子。

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化合物库组成

化合物库信息示例

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Empty	Vadadustat	TAK875	TAK-779	Tegobuvir	RN-1734	BMS-687453	AM211	FT011	BMS754807	AAI101	Empty
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Empty	RPW-24	SRT1720 hydrochloride	INH6	SRT 2183	AMG208	Pentadecanoic acid	Apiopaeonoside	Pemirolast potassium	L-Anserine nitrate salt	Sodium Picosulfate	Empty
Empty	100427-26-7	1004316-88-4	10045-45-1	100462-37-1	1004990-28-6	100-51-6	1005-24-9	1005264-47-0	1005334-57-5	1005342-46-0	Empty
Empty	Lercanidipine	Cobicistat	1-Ethyl-2-benzimidazolinone	ROSIRIDIN	PF-AKT400	Benzyl alcohol	1-Methylnicotinamide chloride	MX69	CVT-10216	LCL161	Empty
Empty	1005491-05-3	100-55-0	1005504-62-0	1005883-72-6	100643-71-8	1007207-67-1	10075-50-0	1007647-73-5	100784-20-1	10083-24-6	Empty
Empty	Tirasemtiv	Roniacol	Rg3039	Z433927330	Desloratadine	CH5132799	5-Bromoindole	Smurf1-IN-A01	Halosulfuron-methyl	Piceatannol	Empty
Empty	100872-83-1	100874-08-6	1009119-64-5	1009119-65-6	100929-71-3	1009298-09-2	1009298-59-2	100929-99-5	1009734-33-1	10097-84-4	Empty
Empty	ML346	SB 4	Daclatasvir	Daclatasvir dihydrochloride	NADPH (tetracyclohexanamine)	AZD8055	Vistusertib	PAβN dihydrochloride	HZ1157	Rotundine	Empty
Empty	1009816-48-1	1009817-63-3	1009820-21-6	100986-85-4	101001-34-7	1010411-21-8	1010-60-2	1011244-68-0	1011301-27-1	1011529-10-4	Empty
Empty	Thiamet G	B-AP15	Silmitasertib	Levofloxacin	Pamicogrel	GSK369796 Dihydrochloride	2-Chloronaphthoquinone	TFAP	Tenovin3	Azvudine	Empty
Empty	101152-94-7	101155-02-6	1011557-82-6	1011-74-1	101-20-2	1012054-59-9	101-21-3	101-26-8	101303-98-4	1013101-36-4	Empty
Empty	Milnacipran hydrochloride	BW-A78U	Tenovin-6	DL-Normetanephrine hydrochloride	Triclocarban	CUDC101	Chlorpropham	Mestinon	Zacopride hydrochloride	PF04691502	Empty
Empty	101-31-5	1013-69-0	1013750-77-0	1013753-99-5	10138-52-0	1013920-15-4	1013937-63-7	1014691-61-2	101477-54-7	101494-95-5	Empty
Empty	L-Hyoscyamine	Noreugenin	ML-030	BC-1382	Gadolinium chloride	Vorolanib	VTP-27999 TFA	GSK0660	Lomerizine hydrochloride	8-CHLOROQUINAZOLIN-4(1H)-ONE	Empty

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