

p38 Mitogen-activated Protein (MAP) Kinase Focused Library
产品编号LF5000
p38 MAP激酶家族包含四个成员。它们在组织分布、激酶活化调控机制及下游底物磷酸化过程方面存在差异,同时对p38 MAP激酶抑制剂的敏感性也有所不同。其中研究最为深入的是p38α亚型,该亚型在适宜的刺激条件下可于多种造血细胞和非造血细胞中观察到活化现象。
p38 MAP激酶抑制剂在多种疾病模型中显示出疗效,包括炎症性关节炎及其他关节疾病、脓毒症休克以及心肌损伤。在所有案例中,关键细胞类型的p38活化与疾病发生和进展密切相关。使用p38 MAP激酶抑制剂治疗可同时减弱p38活化程度和疾病严重程度。在临床前研究中,多种结构各异的p38 MAP激酶抑制剂已得到广泛验证。
该靶向化合物库专注于I型抑制剂,这类抑制剂能结合于激活环DFG-in构象的蛋白质ATP结合位点。包括超过1,100个潜在的p38丝裂原活化蛋白(MAP)激酶抑制剂。
规格
研究采用PDB编号3BV2记录的p38 MAPK结构进行分子对接分析,使用DOCK4.0-6.0程序完成对接计算与结果解析。蛋白质结构制备与分子动力学模拟通过GROMACS软件实现,配体分子则经由GAMESS和GROMACS处理。对接过程的关键特征与约束条件基于蛋白质结合口袋的以下关键残基确定:Met109、Glu110、Asp168、Glu71、Lys53构成供体/受体位点;Thr106、Phe169、Leu74、Leu75、Val30、Leu171、Leu108负责疏水相互作用(图1)。
通过对符合类药五原则和韦伯规则的化合物进行预筛选,最终鉴定出1100余种潜在MAP激酶抑制剂。
