核受体筛选化合物库

基于二维相似度的核受体聚焦库
该配体筛选库通过二维指纹相似性搜索方法，从高通量化合物库中筛选而得。筛选过程以ChEMBL数据库中核受体及其复杂生物活性数据为参照，设定最低塔尼莫托系数大于0.85，最终识别出超过68,000个已报道核受体调节剂的结构类似物。通过差异性筛选进一步优化后，得到包含逾31,900个类药性小分子的最终化合物集合，靶向包括以下受体：

基于对接技术的核受体靶向化合物库
本筛选库专为核受体研究设计，包含12,800多种小分子化合物。这些化合物通过蛋白-配体对接方法从专有高通量化合物库中筛选得出，筛选过程采用薛定谔公司的Glide软件。基于以下核受体的可用晶体结构（图1），我们设定了氢键与疏水作用约束条件，结合结合位点的静电势图，构建了对接/筛选模型：

为评估对接流程的效能，我们采用从ChEMBL数据库中提取的参考化合物集（50至1100种化合物，具体数量因靶点而异）——这些化合物均具有已知的核受体拮抗活性（IC50值低于1微摩尔）——以及随机选取的非活性化合物集，对每个模型进行了验证。完成计算机筛选后，通过PAINS过滤器和内部药物化学过滤器排除了具有非预期结构的分子。最终根据对接参考集的对接得分值，对该筛选范围内的化合物进行排序。 本数据库近期基于药效团假说，并综合考虑配体-蛋白质复合物特性，通过针对以下靶点进行筛选而扩充了化合物库： • 核受体亚家族4A组成员1（NR4A1） • 核受体亚家族5A组成员2（NR5A2） ***核受体亚家族4A组成员1（NR4A1）*** NR4A1作为一种孤儿核受体，在人体多种生理过程中发挥关键作用。它是Hippo信号通路的核心组分，通过调控细胞增殖与凋亡维持组织稳态和器官尺寸控制。这一独特功能使其成为癌症治疗的重要靶点，尤其在肝细胞癌研究中备受关注。NR4A1还能通过抑制RNA聚合酶II的转录延伸过程，成为乳腺癌治疗的潜在靶点。此外，该受体通过调节肌成纤维细胞功能抑制肠道纤维化，为纤维化疾病治疗提供新思路。 在免疫治疗领域，NR4A1作为诱导T细胞功能失调的关键调控因子，成为对抗肿瘤相关免疫功能障碍的重要靶标。该受体还参与能量平衡及糖脂代谢的调控，因此也是治疗代谢紊乱相关疾病的潜在靶点。 **核心特征：** • 方法：基于药效团的虚拟筛选 • 使用的X射线数据：RCSB PDB编号 - 3V3Q • 使用过滤器：无 • 筛选化合物数量：3,557个

核受体亚家族5A组成员2（NR5A2）
NR5A2作为一种核受体，在调控涉及多种生物过程的基因表达中发挥关键作用。这些过程包括胆汁酸合成、胆固醇稳态维持、甘油三酯合成、胚胎干细胞多能性调控、类固醇生成、胚胎发育、细胞分化以及成体稳态维持。此外，NR5A2能够影响多种癌基因的表达，从而对多种癌症类型产生影响。该受体还参与胰腺相关的多种生理和病理过程。同时，NR5A2可调控神经元的增殖与分化，促进轴突生长。
由于其在这些关键过程中的广泛参与，NR5A2成为治疗癌症及其他疾病极具潜力的靶点。
核心特征：
• 方法：基于药效团的虚拟筛选
• 使用的X射线数据：RCSB PDB编号 - 6OQX
• 使用过滤器：无
• 筛选化合物数量：6,640个

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。