Nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) targeted library
产品编号OA9000
烟碱型乙酰胆碱受体(nAChR)是神经递质调控的离子通道复合物,负责快速突触传递,在昆虫中枢神经系统中起重要作用,是杀虫剂作用的重要靶点。
OTAVAchemicals提供烟碱乙酰胆碱受体靶向库包含495种化合物。
规格
本研究采用贝叶斯建模和药效团方法设计了这一特殊筛选库,其中包含预测的靶向烟碱型乙酰胆碱受体的杀虫剂。
针对神经毒蕈碱乙酰胆碱受体(nAChR)的作用机制,研究人员将已知杀虫剂分为五个训练集用于建模。基于配体的药效团模型通过优化不同特征参数和排除体积进行开发、优化与验证。OTAVA化学筛选库针对最佳优化的药效团模型(每个训练集选取3-5个模型)进行了筛选测试。实验结果采用两种特殊重评分函数重新计算:第一种基于药效团特征权重,第二种则采用分子描述符(定量构效关系,QSAR)。
此外,基于指纹特征(ECFP4、ECFP6、FCFP4、FCFP6)和不同分子描述符(LogP、分子量、氢受体与供体数量、可旋转键数量、环数及分子PSA值),针对相同训练集构建了贝叶斯模型。OTAVAchemicals筛选库对这些模型进行了测试验证。
将药效团建模筛选出的高分化合物与贝叶斯建模筛选出的高分化合物进行交叉验证。仅对两种方法共同筛选出的化合物进行目视分析,并将其纳入化合物库。