
Natural Product-like Fragment Library
产品编号LF8600
天然产物以其巨大的骨架多样性和结构复杂性为特征。这与天然化合物中发现的分子骨架的类药性共同为设计用于药物发现的新型类天然产物化合物库提供了基础。将类天然产物框架应用于基于片段的药物发现(FBDD)可能受益于利用平均合成分子未占据的、经生物学验证的化学空间区域。
Life Chemicals推出了一个专有的类天然产物片段库,通过骨架树(Scaffold Tree)方法生成。最终的筛选库包含超过4,200种与天然化合物相似的合成片段,作为有吸引力的化学空间中FBDD的有前景起点。
规格
化合物筛选
通过骨架树分析,从通用天然产物数据库和COCONUT在线天然产物集合数据库(当前版本包含超过406,000个结构)中提取了超过17,000个二级和三级骨架。筛选通过对数据库中存在的类天然骨架和最相关基团进行子结构搜索完成,这些基团包括:香豆素类、尿石素类、黄酮类、橙酮类、生物碱类、胆汁酸类、芳基苯并噻唑类、苯并呋喃类、苯并噁唑类、碳水化合物类、芳基哌嗪类、芳基哌啶类、苯二氮䓬类、苯并噻吩类、苄基哌啶类、吲哚类、二氢吲哚类、中氮茚类、异喹啉类、嘌呤类、喹唑啉酮类、喹啉类、喹喔啉类、甾体类、四氢异喹啉类、色酮类、四氢喹啉类等。
在排除非期望和原始化学类型后,剩余约4,000个结构被用于对Life Chemicals的高通量筛选(HTS)化合物库和通用片段库进行子结构搜索。此外,来自与上述类天然产物骨架集相似度超过85%的骨架的类片段分子也被纳入。最后,进行了额外的结构过滤,最终得到4,200种具有天然化合物样骨架的片段。
