图1. DNA复制中的解旋酶(左图,Armin Mortazavi绘制)及解旋酶超家族。
为构建这个以解旋酶为核心的筛选集,我们首先整合了来自ChEMBL、PubChem、DrugBank及科学文献的数据,汇集了已知具有解旋酶相关活性的分子参考集。通过提取专利和文献出版物中的可用数据,我们最终建立了包含2,745个生物活性化合物的参考数据库,这些化合物来自九种不同的解旋酶检测实验,涵盖以下解旋酶靶点:
  - Probable global transcription activator SNF2L2 (helicase activity)
 
  - Bloom syndrome protein (ATP-dependent DNA helicase)
 
  - Replication protein E1 (ATP-dependent DNA helicase)
 
  - Transcription activator BRG1 (helicase activity)
 
 - Eukaryotic initiation factor 4A-III (ATP-dependent RNA helicase)
 
 - Hepatitis C virus NS3 protease/helicase
 
 - ATP-dependent RNA helicase DDX3X
 
 - Replicative DNA helicase
 
 - Chromo domain-containing protein 1 (helicase activity)
 
 - ATP-dependent DNA helicase Q1
 
 - DnaC helicase
 
 - Werner syndrome ATP-dependent helicase
 
 - Replicase polyprotein 1ab
 
 - Bloom syndrome protein (ATP-dependent DNA helicase)
 
随后,对内部数据库进行了分子描述符分析,采用84%的Tanimoto相似度阈值筛选参考集中的小分子类似物,最终鉴定出3800余种具有解旋酶抑制潜力的筛选化合物。
图 2. 解旋酶靶向库中的靶点分布
*ChEMBL 数据库中的文献编号:CHEMBL3822370、CHEMBL4014334、CHEMBL1134109、CHEMBL1201862、CHEMBL1145280、CHEMBL1148307、CHEMBL1139458、CHEMBL4049423、CHEMBL1138995