金葡菌分选酶 A 抑制剂库

本文库共计 22127 个化合物；
包含 20000 余种靶向聚焦型化合物；
内置 700 余个配体效率（LE）预测值优异的化合物；
库内全部化合物均适用于药物化学改造。

研究方法与建库运算流程

该文库是集成构象集虚拟筛选首个落地成果，突破了仅依靠单一蛋白构象的固有思路。
整套方法整合多项前沿技术：借助分子动力学（MD）生成 100 种分子构象；依托分子动力学输出的构象集，搭建适用于肽模拟物的集成构象对接方案；将显式分子动力学模拟引入大规模虚拟筛选工作流。
文库搭建算法流程：以 ChemDiv 商用现货化合物库为原料，依次执行 PAINS（警示毒性结构）过滤、机器学习筛选与分子聚类；采用 AD-GPU 程序对聚类中心开展集成构象分子对接；最后完成聚类扩充，得到成品文库。

合理化设计思路与技术优势

文库基于集成对接打分、构象覆盖度完成理性筛选设计；
所有入选化合物，均优先保证在分选酶 A（SrtA）主要蛋白构象下拥有理想的结合自由能；
该策略可从统计学层面提升生化实验的阳性命中率；
文库设计能够最大程度规避构象因素造成的假阴性结果；
该化合物文库可为后续实验验证提供具备充分机理依据的起始筛选原料。