已上市药物类似物化合物库

以美国食品药品监督管理局（FDA）、欧洲药品管理局（EMA）和日本药品医疗器械综合机构（PMDA）为代表的权威监管机构，分别负责确保美国、欧洲和日本药品的安全性、有效性和质量[1-3]。经这些机构批准的化合物均已通过严格评估，并获临床证实可有效治疗多种疾病。

与这些已批准药物结构相似的分子在药物发现与开发中具有重要价值，因为它们更可能具备生物利用度、靶点特异性、安全性等良好的药理特性。这种相似性可显著降低药物早期开发的时间与成本，并提高筛选出可进一步优化及进入临床试验的候选化合物的可能性。

我们的化学信息学团队对专有的高通量筛选化合物集合（HTS Compound Collection）进行了深入分析，从中精选出950余个类药筛选化合物，这些化合物与各国监管机构批准上市的药物结构相似：

• 筛选方法：基于2D指纹的相似性搜索，针对参考数据库的Tanimoto系数≥0.85（图1）
• 参考数据库：截至2025年1月，主要监管机构批准药物的完整清单：

• U.S. Food and Drug Administration (FDA)
• European Medicines Agency (EMA)
• Pharmaceuticals and Medical Devices Agency (PMDA)

• 化合物库组成：168个重复化合物和788个近似类似物 • 化合物详细信息：可提供SDF（结构-数据文件），其中包含每个化合物的全面信息，包括化学结构、计算所得理化参数、参考药物名称及相应的相似度值

该化合物库以类似物结构的多样性著称（图2-3），大多数组合中每个已批准药物对应1至6个类似物。筛选重点关注结构差异较大的化合物（Tanimoto相似度为0.85–0.93），从而在新颖性与相关性之间取得平衡。这一策略有助于筛选出具有潜在新特性的化合物，同时保持其与经过充分研究、已获批准药物的相似性。

• 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
• 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
• 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。