螯合剂片段化合物库

Name: 螯合剂片段化合物库
Brand: TargetMol
SKU: LF8900

Chelator Fragment Library

很棒

产品编号LF8900

基于片段的先导设计（FBLD），有时也称为基于片段的药物发现（FBDD），是发现生物活性化合物的一种日益重要的策略。文献中已描述了将FBLD应用于具有医学意义的金属蛋白靶点的研究。然而，迄今为止，基于金属螯合物的片段库在FBLD应用中的设计、合成和使用尚未得到广泛研究。已有研究表明，几种小分子螯合剂能有效抑制与癌症、炎症、感染、心血管、神经退行性等多种疾病相关的金属蛋白。研究已确定以下金属结合基团：吡啶甲酸类、喹啉类、嘧啶类、羟基吡喃酮类、羟基吡啶酮类和水杨酸类。

在Life Chemicals，我们基于Life Chemicals螯合剂聚焦筛选库以及高通量筛选（HTS）化合物库和通用片段库，设计了这一螯合剂片段库，包含超过4,600种类药螯合片段。

TargetMol 的所有产品和服务仅用于科学研究，不能被用于人体，我们也不向个人提供产品和服务。

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产品编号LF8900

螯合剂片段化合物库

规格

1 mg
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)

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产品描述

背景

基于金属螯合原理，有四种主要方法采用不同的金属结合基团（图1）：

通过形成中性、亲脂性复合物，使金属跨生物膜重新分布
利用金属螯合作用形成蛋白质-金属-螯合剂三元复合物，使酶活性位点失活
通过形成螯合物增强金属离子的反应活性，例如促进氧化还原循环和活性氧或其他细胞毒性产物的生成
在形成螯合物时使金属失活，从而防止发生芬顿化学（即氧化还原循环催化活性氧的形成）

使用金属螯合部分的FBLD将特别适用于发现新型金属酶抑制剂作为螯合剂，即它们能够：

通常表现出高结合亲和力
提供多样化的分子平台
在缺乏复合物实验结构数据的情况下，其结合金属离子的倾向性允许更好地预测其在蛋白质活性位点中的可能结合位置

图1. 螯合剂的主要类别。

化合物筛选

为构建已知螯合剂片段的参考集，我们检索了ChEMBL、PubChem和DrugBank数据库，以及CFL-1螯合片段库（该库在针对多种金属酶的筛选研究中显示出高检出率）。

随后，我们将子结构搜索方法应用于高通量筛选（HTS）化合物库，接着通过理化参数和生物学参数对所选片段进行过滤。对专有的螯合剂聚焦筛选库进行理化参数过滤，以筛选出类片段分子。

所有具有潜在螯合作用的所选类片段化合物均通过了子结构、相似性和理化性质过滤器，并根据扩展的利平斯基三规则（Rule of Three）进行了缩小。所有含有毒性、不良和反应性基团的化合物均已从该筛选库中过滤去除。

理化参数总结如下表所示：

Parameter	Value	Average	Parameter	Value	Average
MW	< 300	236	Acceptors	≤ 9	3.2
cLogP	< 3	0.06	TPSA	< 163	76.9
RotBonds	≤ 10	1.9	Rings	0-5	1.9
Donors	≤ 5	1.6	LogSw	> -6	-2.3