Carbonic Anhydrase II Library
产品编号DF4300
ChemDiv设计了一个包含5000种化合物的新型库,这些化合物选择性抑制碳酸酐酶II。
碳酸酐酶II(CA II)是人体中的一种关键酶,主要负责调节酸碱平衡和二氧化碳运输。它催化二氧化碳可逆水合为碳酸氢盐和质子,这一反应对许多生理过程至关重要,包括呼吸、离子运输和pH稳态。CA II存在于全身各种组织中,在红细胞中浓度特别高,有助于血液循环中二氧化碳和氧气的有效交换。由于其参与肾脏和骨骼代谢,其功能障碍与多种疾病相关,如肾小管酸中毒和骨硬化症。CA II是治疗药物的潜在靶点,特别是利尿剂和抗青光眼药物。对CA II的研究不断揭示其生化机制及治疗各种健康问题的潜力。
目前市场上有几种已批准的药物用于治疗高眼压、癫痫、偏头痛以及作为利尿剂。
CA II作为新型治疗药物的靶点正在被广泛研究,这一点在PubMed上迅速增长的研究出版物、在PDB数据库中存入结构的不同出版物以及Chembl数据库中超过12K的相关配体中得到体现。
规格
ACII虚拟筛选的主要步骤包括:
1.子结构搜索:此步骤假定识别具有特定化学结构或特征(化学型)的化合物,这些化合物已知与CA II相互作用。
2.化合物对接:将ChemDiv库存中的约10,000种化合物对接到CA II的结合位点是虚拟筛选的实际规模。此过程涉及计算预测小分子(如药物)如何与酶结合。
3.基于对接分数的选择:基于ICM对接分数(< -20.0)和Flare分数(< -7)选择约6,000种化合物是标准方法。这些分数有助于预测化合物的结合亲和力。
4.静电互补性计算:此步骤涉及评估小分子的电子特性如何与目标酶互补。提到了相关性> 0.1的截止值,但应上下文验证此特定值的相关性。
5.物理化学性质预测:使用ICM模型预测化合物的物理化学性质是确保药物相似性和分子可行性的关键步骤。
6.最终选择:该过程以最终选择约5,000种专门针对CA II的化合物结束。此数字似乎与初始过滤步骤一致。