

c-Met (HGFR) Kinase Targeted Library
产品编号LF4500
c-Met,也称为Met或肝细胞生长因子受体(HGFR),是一种受体酪氨酸激酶,在人类癌症中经常发生异常调节。c-Met激酶在各种肿瘤的恶性表型中显示异常活化,因此成为癌症治疗的药物靶点引起了广泛关注。目前有一系列具有不同化学结构的c-Met抑制剂正在进行临床研究。例如,卡博替尼(Cabozantinib)在2012年被FDA批准用于髓性甲状腺癌的治疗,证明了c-Met抑制在癌症治疗中的可行性。
我们设计了一个潜在选择性c-Met抑制剂的筛选化合物库,该库是基于蛋白结合位点的关键氨基酸与已知有效抑制剂的特征进行比较而设计的。该库中的化合物总数约为1,100个。
规格
通过比对蛋白质结合位点的关键氨基酸与已知强效抑制剂的特征,设计了潜在选择性c-Met抑制剂的筛选化合物库。基于PDB编号2RFS的X射线晶体结构,我们构建了c-Met激酶结合位点的对接模型,并采用ChEMBL数据库中的已知抑制剂参考集验证筛选模型。通过Surflex-Dock工具(SYBYL-X)对接已知活性化合物,确定了配体结合的关键氨基酸残基,进而使用SYBYL-X的Unity模块制备了蛋白质结合位点的Unity查询模型(筛选工具)。该查询模型包含以下特征:受体/供体位点、疏水区域及蛋白质表面空间约束(图1)。
我们对库存化合物库进行了全面过滤,排除具有泛筛选干扰化合物(PAINS)特性的分子。筛选程序采用柔性搜索模式和特征约束限制(至少4个匹配特征),应用于预过滤后的库存化合物集合。
