辅助转运蛋白靶标化合物库
Auxiliary transport proteins targeted library
很棒产品编号OA9500
转运蛋白是跨越细胞膜的蛋白质，负责调控小分子物质进出细胞的运输过程。这类蛋白在中枢神经系统神经元间的化学信号传递中起着关键作用，通过调节突触处神经递质浓度来实现功能。此外，转运蛋白还承担着双重重要功能：既能阻挡有害外来物质进入细胞，又能确保细胞生命周期所需的关键分子顺利通过。目前，绝大多数转运蛋白已成为药物研发的重要靶点。
辅助转运蛋白同样是重要的研究对象。这类蛋白质通过特定机制促进物质跨膜运输，但自身并不直接参与运输过程。它们始终与已建立的转运系统协同工作，可能承担以下功能：为运输过程提供能量耦合支持、在复合体形成中发挥结构作用、执行生物合成或稳定性调控功能，以及参与信号传导调节。
OTAVAchemicals 提供辅助转运蛋白靶向库（182个化合物）。该库的设计使用了贝叶斯统计方法。从ChEMBL 数据库中选取了具有已知活性的主要转运蛋白类和辅助转运蛋白的配体模板（训练集），用于贝叶斯建模。
产品编号OA9500
辅助转运蛋白靶标化合物库规格
- 1 mg
- 100 μL x 10 mM (in DMSO)
- 250 μL x 10 mM (in DMSO)
产品描述
转运蛋白调节剂库的训练集包含三组生物活性参考分子：电化学转运蛋白（溶质载体SLC超家族、囊泡神经递质转运蛋白家族）的活性阈值设为10 nM；初级主动转运蛋白（ATP结合盒、P型/类P型/类F型/类V型ATP酶、内质网逆向转运体家族、氧化还原驱动型转运蛋白）及其他类型（跨膜单电子传递载体、基团转运体）的活性阈值设为100 nM。辅助转运蛋白靶向库的训练集则包含钙通道辅助亚基α2δ家族、脂肪酸结合蛋白家族、钙通道辅助亚基γ家族、钙通道辅助亚基β家族、慢电压门控钾通道辅助蛋白家族、钙激活钾通道辅助亚基慢poke-β家族及电压门控钾通道β亚基家族的生物活性参考分子，其活性阈值同样设定为10 nM。
针对每个训练集，我们基于FCFP4、ECFP4、FCFP6和ECFP6分子指纹特征及分子描述符（包括LogP值、分子量、环数、可旋转键数、氢受体与供体数量以及分子极性表面积）构建了模型。首先计算训练集中各分子描述符的取值范围，随后对OTAVAchemicals化合物NCollection中每个待测化合物的相同描述符进行验证，判断其是否符合模板限制条件。若化合物的描述符值与模板限制条件匹配度更高，则该化合物更可能具有活性。所有活性概率均通过特殊数学工具计算得出。贝叶斯模型通过分析化合物在结构特征（包括分子指纹）等所有参数上与模板的相似程度，最终筛选出得分最高的化合物。
该方法的总体方案如下所示：
包装和储存
- 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管；
- 干粉蓝冰运输，DMSO溶液干冰运输；
- 排布：96孔板：1st & 12th 空白对照，384孔板：1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。
化合物库定制
