

Aspartic Protease Screening Libraries
产品编号LF6300
天冬氨酸蛋白酶是蛋白水解酶四大类别之一,其功能是将蛋白质切割成更小的片段。蛋白水解酶也被称为肽酶(因其裂解肽键)和蛋白酶(因其裂解蛋白质)。在天冬氨酸蛋白酶(EC3.4.23)中,两个天冬氨酸共同构成酶的催化机制。这两个天冬氨酸残基的羧酸根协助质子从水分子转移,该水分子作为亲核体攻击待切割肽段或蛋白质的肽键。天冬氨酸蛋白酶存在于所有生命形式中,并在某些疾病进程中发挥关键作用:如高血压、阿尔茨海默病、艾滋病、疟疾、糖尿病或真菌感染。与蛋白酶家族中的其他蛋白酶不同,天然存在的天冬氨酸蛋白酶抑制剂相对罕见。通过研究蛋白酶活性抑制的详细机制,有望为抑制剂设计提供新思路。
我们为此设计了两个专用的潜在天冬氨酸蛋白酶调节剂筛选库,以促进基于蛋白酶药物发现项目的小分子高通量筛选:
• 通过二维相似性筛选的天冬氨酸蛋白酶聚焦库(1,400个化合物)
• 通过基于受体的虚拟筛选的天冬氨酸蛋白酶靶向库(2,300个化合物)
规格
本筛选库采用二维相似性方法设计,包含1,400多种类药性筛选化合物,这些化合物是经实验证实具有活性的已知天冬氨酸蛋白酶抑制剂的小分子类似物。
通过ChEMBL数据库收集了与天冬氨酸蛋白酶相关的生物活性化合物参考库,共包含18,423个化合物。采用MDL分子指纹技术和Tanimoto相似度系数(阈值设为80%),对内部数据库中与参考库相似的化合物进行检索。用于构建该筛选库的药物靶点包括(图1):
• 组织蛋白酶D
• 内切蛋白酶
• 肾素
• 疟原虫天冬氨酸蛋白酶2
• HIV1蛋白酶
• γ-分泌酶
• β-分泌酶1
