水通道蛋白筛选化合物库

Name: 水通道蛋白筛选化合物库
Brand: TargetMol
SKU: LF2100

Aquaporin Screening Library

很棒

产品编号LF2100

水通道蛋白（AQPs）是整合膜蛋白，能够选择性地、快速地运输水分子，在某些情况下还可运输甘油、尿素和过氧化氢等小分子溶质穿过细胞膜。这些通道在多种生理过程中发挥关键作用，包括体液稳态、肾功能、支持脑内水稳态及细胞迁移。由于水通道蛋白参与多种疾病，它们已成为有前景的治疗靶点。调控水通道蛋白功能为治疗与水失衡相关的疾病（如水肿、脑肿胀和肾脏疾病）提供了潜在途径。

近年来结构生物学、高通量筛选和计算建模的进展，凸显了通过药物发现靶向AQPs的机遇。主要研究致力于选择性调节水通道蛋白活性，即根据特定疾病状态增强或抑制其功能。已报道的水通道蛋白抑制剂包括乙酰唑胺、唑尼沙胺、布美他尼、AQB013、阿比多尔和柽柳黄素，它们对水通道蛋白1、4和5显示出高活性（图1）。

为促进以水通道蛋白为重点的药物发现项目，Life Chemicals准备了一个专门的水通道蛋白筛选化合物库，包含约6,000种小分子，通过基于受体的方法筛选获得。

TargetMol 的所有产品和服务仅用于科学研究，不能被用于人体，我们也不向个人提供产品和服务。

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化合物库相关信息

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产品编号LF2100

水通道蛋白筛选化合物库

规格

10 μL x 10 mM (in DMSO)
20 μL x 10 mM (in DMSO)
30 μL x 10 mM (in DMSO)
50 μL x 10 mM (in DMSO)
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)

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产品描述

水通道蛋白1、4和5
该化合物库的设计重点针对结合位点3和1。为界定可能的水通道蛋白配体结合位点，我们使用了FTMap服务器。FTMap是一个在线工具，用于结合位点搜索、分子探针（小分子或官能团）在位点体积内的可视化定位以及表面溶剂映射。分子探针簇的重叠区域指示了潜在结合位点的位置。

图1. 已知水通道蛋白抑制剂AQB013（左）、阿比多尔（中）和柽柳黄素（右）在水通道蛋白4结合位点中的对接构象。图中标出了预测与配体原子形成供体/受体相互作用的原子和区域，以及疏水核心区域。

随后，我们针对水通道蛋白1、4和5，使用Flexible Glide对接方法准备了对接网格和约束条件。这些网格用于对Life Chemicals高通量筛选（HTS）化合物库进行配体筛选。之后，我们对三个配体结合位点进行了处理，以便于与一组测试化合物进行对接。接着，使用SYBYL-X对对接的配体构象和接触距离内的氨基酸进行了能量最小化处理。基于测试化合物的对接构象，我们构建了水通道蛋白1、4和5的位点1和位点3的对接模型（图1-2）。最后，将每个特定靶点相关的化合物子集分别整理，以备进一步分析。

关键参数

方法：分子对接
使用的X射线数据：3GD8
约束条件：无
允许蛋白质可旋转基团：是
使用的过滤器：PAINS、毒性基团、反应性基团
筛选出的化合物数量：1004

图2. 水通道蛋白-4结合位点空腔示意图，其中展示了排名第一的化合物F3260-0485在结合位点1中的结合状态。点状表示孔道表面，参与结合过程的残基以深灰色标出。

AQP7

AQP7是水通道蛋白家族的成员之一，该家族是一组主要参与水、甘油及其他小分子溶质跨细胞膜运输的膜蛋白。AQP7在脂肪组织、肾脏和睾丸中高表达，在甘油代谢和渗透压调节中发挥重要作用。在脂肪细胞中，AQP7介导甘油的流出，这是脂质代谢和能量稳态中的一个关键过程。AQP7表达失调与代谢性疾病（包括肥胖和胰岛素抵抗）有关。其甘油通道活性还参与睾丸中的精子发生以及肾脏中的甘油处理。

我们预测了水通道蛋白受体（PDB ID: 8C9H）表面的潜在结合位点，并采用了基于位点和基于配体的两种对接方法。选择位点1（SiteScore = 1.065）用于针对Life Chemicals高通量筛选（HTS）化合物库的标准精度配体对接（图1）。此外，对接位点也根据8C9H结构中显示的配体相互作用进行了映射和利用。两种方法的结果合并后，得到一组包含9,554种化合物的最终集合，其对接得分低于-8.99。随后的差异性选择将初始筛选结果减半。

由此，为该nAChR靶向筛选集选出了超过900种得分最高的筛选化合物。所有展示的化合物均符合QikProp参数和描述符，且对接得分值低于-10。

关键参数