3D 化合物库（用于HTS）

Name: 3D 化合物库（用于HTS）
Brand: TargetMol
SKU: LF7200

3D Compound Libraries for HTS

很棒

产品编号LF7200

自由配体的三维形状是其被目标生物分子识别及与结合位点亲和力的关键特征。为了与蛋白质靶标紧密结合，药物配体首先应具备合适的构象和空间互补性，以有效适应结合位点。若分子形状需发生显著变化，将需要大量活化能，使此类化合物不适合作为药物。相反，若分子已处于“生物活性构象”（适合结合的形态），则更可能紧密结合并成为良好药物。
近年来，在药物发现项目的高通量筛选中，具有多样化和完善三维形状的非平面筛选化合物已成为最具吸引力的选择。研究表明，命中化合物的更高三维性（3D）与其成功通过各个临床开发阶段密切相关。
毫无疑问，使用更为复杂、更具三维特性的富含sp3杂化碳的筛选化合物，能够显著扩展化学空间，从而在探索更具挑战性的生物靶标时提供优势。
目前，可供您选择的专有三维类药筛选化合物库如下：
三维多样性化合物库（24,800种化合物）
基于三维药效团的筛选库（8,800种化合物）
此外，我们还提供包含15,000种非平面类分子片段的3D形状片段库，以支持高效的基于片段的药物发现（FBDD）。

TargetMol 的所有产品和服务仅用于科学研究，不能被用于人体，我们也不向个人提供产品和服务。

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产品编号LF7200

3D 化合物库（用于HTS）

规格

1 mg
100 μL x 10 mM (in DMSO)
250 μL x 10 mM (in DMSO)

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产品描述

3D形状多样性化合物库

所谓的“3D形状性”是通过对主惯性矩（PMI）、最佳拟合平面（PBF）参数、Fsp³以及其他几个目前描述分子形状的最佳指标进行阈值限定来定义的。然而，没有一个指标是百分之百可靠的。Life Chemicals的高通量筛选（HTS）化合物库通过PMI方法进行了过滤，PMI是目前应用的最有效方法之一[3-5]，使我们获得了超过244,000个分子。随后，通过化学多样性进一步缩小选择范围，最终得到超过24,800种富含3D形状的小分子，覆盖了广泛的化学空间。

图1. 3D形状多样性化合物库中PMI（主惯性矩）的分布情况。

图2. 3D形状多样性化合物库中化合物的理化数值分布情况。

基于3D药效团的多样性库

Life Chemicals的高通量筛选（HTS）化合物库通过一系列基于已发表文献选择的理化参数和三维性参数进行了过滤（详见表1）。所得子集进一步通过PAINS过滤器以及内部开发的毒性团和非期望官能团过滤器进行了精炼。通过结构多样性进一步缩小化合物集合，最终得到超过8,800种3D形状的类药筛选化合物。

表1. 3D形状多样性化合物库的理化参数

Physicochemical parameter	Range	Average Value
MW	250-500	353.74
FSP³	≥0.35	0.47
ClogP	≤10	2.04
TPSA	≤140	79.44
H-acceptors	≤10	4.05
H-donors	≤5	1.30
Rotatable Bonds	≤10	4.69
Molecular Flexibility	≥0.35	0.47
Molecular Complexity	≥0.53	0.79
Rings	≥ 1	3.24
npr1	≥ 0.15	0.21
npr2	≥ 0.85	0.91
Structure in-house filters	all