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3D分子砌块化合物库

3D BBs Collection

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产品编号PB1100

普林斯顿生物分子研究中心的3D BBs(分子砌块)集合包含453个化合物。

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化合物库相关信息
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SDF

产品编号PB1100

3D分子砌块化合物库

规格

  • 1 mg
  • 100 μL x 10 mM (in DMSO)
  • 250 μL x 10 mM (in DMSO)
询价 & 定制

标签产品描述

绝大多数现有药物都集中在富含sp²杂化芳香环的核心结构上。此外,我们经常可以在针对不同疾病开发的多种药物中发现相同的芳香核心片段,这导致了药物特异性(选择性)较低,并增加了副作用的发生风险。扩大使用具有更多三维(3D)特性的构建模块(Building Blocks),将有助于获取比当前所用更大的生物活性化合物及药物的化学空间。自然界以互补的三维方式识别小分子。使用更复杂且富sp³碳(即更具三维结构特性,Fsp3更高)的化合物,无疑能够拓展现有的化学空间,从而在探索更具挑战性的生物靶点时可能具有优势。

尽管大多数市售化合物库在多样性方面表现良好,并经过筛选以确保具有良好的理化性质平衡,但它们普遍存在形状多样性(shape diversity)有限的问题。这种“扁平化”特征可能解释了为什么它们在针对某些需要具有不同取代方向药效团(pharmacophores)以与蛋白质相互作用的靶点时,发现苗头化合物(hits)的成功率较低。

药物化学领域日益注重增加构建模块的多样性,旨在高效生成一系列在骨架结构、立体化学特性以及相应生物活性方面具有多样性的分子。

我们为您精心设计了一套具有高度富sp³碳骨架的新型且结构多样的构建模块。以下基本标准被用于提升核心构建模块的三维形状功能性:

  • Fsp3 > 0.65
  • 至少含有1个手性中心
  • 拓扑极性表面积(TPSA) < 80 Ų
  • 经过充分的新颖性筛查
  • 易于功能化(理想情况下具有2个可功能化位点)
  • 最终筛选基于主惯性矩图(PMI plot)中的分布情况

该构建模块库中的构建模块总数量:453种

 3D BBs Collection
PMI图显示,与市售的包含56,974个化合物的构建模块数据库(蓝色点;Zbb Now,http://zinc.docking.org/subsets/zbb-now)相比,普林斯顿生物分子公司(Princeton BioMolecular)的3D构建模块数据集(以红点表示)在“三维形状空间”的覆盖范围上更加高效且具有高度多样性。

标签包装和储存

  • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
  • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
  • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。

Packaging And Storage | 陶术生物包装和储存

  • 可选用DMSO耐受的96/384孔板或2D 条形码编码管;
  • 干粉蓝冰运输,DMSO溶液干冰运输;
  • 排布:96孔板:1st & 12th 空白对照,384孔板:1st & 2nd & 23th & 24th空白对照。

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