3D药效团多样性化合物库

3D-Pharmacophore Based Diversity Library

产品编号： DD5400

蛋白质具有不同的空间几何结构和潜在的热点/结合点，可与小分子化合物发生结合。根据“Picklock”概念，可以应用一个包含具有潜在药效团点的高多样性化合物的库来获得在高通量筛选（HTS）活动中的初步筛选结果。

具体步骤如下：

对ChemDiv库中的化合物（超过1.6百万个化合物）应用软性较大共同片段（MCFs）和药物样性过滤器。这些过滤器有助于根据结构特征和药物样性的特点缩小化合物选择范围。

对于每个化合物，使用Corina软件生成其三维构象。这一步确保化合物以其三维构象的形式进行表示，这对于准确评估其结合相互作用至关重要。

针对每个化合物的构象，自动构建三个非常不相似的三中心药效团假设。这些药效团假设主要关注氢键受体（HBA）、氢键供体（HBD）和疏水/亲脂/芳香（HYD/LIPO/ARO）点。

然后，将所有生成的药效团假设进行聚类，以获得多样性高的三维模型池。

使用该池中的药效团假设对化合物进行计算机筛选。

然后从每个药效团池中选择多样性高的虚拟筛选结果。这些化合物适当地覆盖了所需的化学空间。

ChemDiv’s 3D-Pharmacophore Based Diversity 库包含 52,000 compounds.蛋白质包含在其空间几何形状和小分子化合物的潜在热点/结合点方面不同的结合位点。根据“Picklock”概念，在HTS 活动期间，任何蛋白质都可以应用包含较低数量的潜在药效团点多样性高的化合物库，以获得初级命中率。

陶术生物的所有产品和服务仅用于科学研究，我们不为任何个人用途提供产品和服务。

产品规格

技术资料

陶术生物化合物库目录(28.1MB)

库化合物信息

Excel

SDF

产品描述

具体步骤如下：

对于每个化合物，使用Corina软件生成其三维构象。这一步确保化合物以其三维构象的形式进行表示，这对于准确评估其结合相互作用至关重要。

然后，将所有生成的药效团假设进行聚类，以获得高度多样性的三维模型池。

使用该池中的药效团假设对化合物进行计算机筛选。

然后从每个药效团池中选择高度多样性的虚拟筛选结果。这些化合物适当地覆盖了所需的化学空间。

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化合物库组成

化合物库信息示例

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